До развала СССР в 1991 году Конюхова снялась еще в двух фильмах: «Щенок» (1989; завуч) и «Все впереди» (1991; мать Любы). Символично, что свою последнюю роль в советском кино Конюхова сыграла в свой «именной» год Козы (1991). Однако, следуя названию последнего фильма, впереди Конюхову ждали далеко не лучшие годы. Во-первых, ее прекратили приглашать сниматься в кино. Во-вторых - она потеряла работу и в театре. Долгие годы она работала в Театре-студии киноактера, который помогал ей компенсировать ее не слишком большую востребованность в кино: на сцене этого театра Конюхова переиграла множество ролей, среди которых были и классические: по произведениям Ф. Достоевского, Лопе де Вега, В. Шекспира. Однако в конце 1991 года рухнул Советский Союз и к руководству в Театре-студии киноактера пришли новые люди, которые взялись увольнять многих актеров-старожилов как ненужный балласт. В 1995 году в их число угодила и Конюхова. Это были одни из самых тяжелых лет в ее жизни: пенсия мизерная, работы почти никакой. А вокруг вакханалия ельцинизма с его оголтелым пренебрежением к недавнему советскому прошлому. Только то, что Конюховой удалось устроиться работать преподавателем актерского мастерства в Детскую академию, помогало ей сводить концы с концами.