Как писали по поводу этого убийства «Известия»: «По мнению тех, кто хорошо знаком с ситуацией, возникшей вокруг фонда, наиболее вероятны две версии: Михаила Лиходея убили те, чьих надежд он не оправдал. И вторая — убийство совершено с целью дискредитации афганского движения».

Касаясь преступлений, где главным элементом являются взрывчатые вещества, стоит упомянуть, что именно в ноябре 1994 года была разоблачена преступная группа из Чучковской бригады спецназа Главного разведывательного управления МО РФ, которая с марта 1993 года занималась хищением и последующей перепродажей криминальным группировкам взрывчатки. В эту группу входили шесть прапорщиков и офицеров и даже заместитель командира бригады. А вышли на эту банду следующим образом.

В ходе расследования убийства журналиста Дмитрия Холодова, который первым заговорил о криминале в Чучковской бригаде, сотрудники ФСБ выяснили, что в бригаде действительно происходят вопиющие нарушения. Преступная группа во главе с неким полковником, заместителем начальника одного из структурных подразделений ГРУ, похищала взрывчатку до элементарного легко и просто. Часть боеприпасов списывалась как израсходованная на боевых учениях, а часть оформлялась как выданная по распоряжению вышестоящего подразделения, то есть самого ГРУ. Таким образом за два с половиной года было похищено 300 килограммов взрывчатки, десятки тысяч патронов и много другого военного имущества. Все это затем продавалось за такие приличные деньги, что главный организатор хищений сумел купить себе за год три иномарки.