Когда через четыре месяца после убийства Линкольна американский консул в Лондоне сообщил в Вашингтон, что Сарратта видели в Англии, ему ответили, что после консультации с военным министром признано нецелесообразным что-либо предпринимать. Позднее Сарратт объявился в Италии. Но и тут Стэнтон ничего не предпринял; напрасно государственный секретарь Сьюард побуждал военного министра похлопотать об аресте заговорщика. Стэнтон вообще не реагировал. Однако Сьюард не сдавался и с помощью морского министра в конце концов добился желаемого. В декабре 1866 года в Египет был послан корвет для поимки бежавшего туда Сарратта. Однако когда тот предстал наконец перед Фемидой, ни к какому решению суд не пришел. Второй судебный процесс против него был прекращен за давностью лет. Роско убежден, что с самого начала и при поимке Сарратта, и при организации процесса были намеренно допущены серьезные проволочки.
Когда речь заходит о загадочных моментах в деле об убийстве Линкольна, постоянно всплывает имя военного министра Стэнтона. Спустя почти сто лет после описываемых событий, в 1961 году, была сделана примечательная находка, подкрепившая предположения о возможной причастности Стэнтона к покушению на убийство президента. В букинистическом магазине в Филадельфии обнаружилась книга, принадлежавшая некогда бригадному генералу Лафайету К. Бейкеру, бывшему начальнику тайной полиции северян. На переплетной крышке книги Бейкер, к тому времени рассорившийся со Стэнтоном, оставил любопытную запись, сделанную 2 мая 1868 года. Начинается она так: «Меня постоянно преследуют. Это профессионалы. Мне от них не уйти».
Затем в форме аллегории Бейкер ведет речь об убийстве Линкольна: «Жили в Новом Риме три человека: Иуда, Брут и Шпион. Когда поверженный умирал, явился Иуда и почтил того, кого ненавидел. И когда он увидел его кончину, то сказал: «Теперь ему уготована вечность. А нация — мне!»
Последние слова можно воспринять как парафраз слов, сказанных Стэнтоном после кончины Линкольна: «Теперь он принадлежит вечности». В конце заметки говорится: «Если кто-либо спросит, что сталось со Шпионом, — это был я. Лафайет К. Бейкер, 2.5.68». Через несколько месяцев Бейкер был мертв. Уже тогда заподозрили, что бывшего генерала отравили.